南宋间，善于辩骨识人的少宋慈意外卷入天火一案，利用候补仵作的身份抓出凶手，怎料凶犯竟是与他情同父子的师父田伯，而田伯的背后，还隐藏着一桩关于二十前的惊天大案。为了寻找当的真相，名声鹊起的宋慈带着捕快乔天宝、发小儿乔小贝、以及佯装失忆的少女天琪踏上了寻迹觅踪之旅。在金陵，他们又破解了孪生姐妹身世之谜。终于到了临安，距离真相越来越近，痛苦却越来越深。宋慈没有想到与自己分别二十的亲生父亲竟然卷在案件之中，而两情相悦的天琪也撕开了伪装，与他刀剑相向，恩断情绝。宋慈含泪将父亲送入大牢，却发现此案另有隐情。面对着父母的离世、爱人的诀别，宋慈强忍痛楚，与丞相史弥远商定请君入瓮之计。以自己为诱饵，引蛇出洞，终将潜藏在南宋的金人一网打尽，还天下一片宁静。