电视动画境界触发者剧情改编自由日本漫画家苇原大介原作的同名漫画。该作品讲述以三门市为背景舞台的故事。

　　三门市，人口28万人。某一天，通往异世界的门在这里打开了。

　　从异世界而来的侵略者“近界民”，任意蹂躏门附近的地区，让整座都市陷入恐惧之中。 就在每个人都认为都市毁灭只是早晚的问题时，突然出现一个神秘的团体击退了近界民。 被称为境界防卫组织“BORDER”的他们，在这边的世界建立了巨大的基地，以对抗陆续来袭的近界民。

　　四年后，近界民空闲游真从异世界来到日本寻找父亲的熟人，并认识了三云修。 修为了解近界民的真相，决定指引及监视人生路不熟的游真，两人的故事随着“BORDER”与“近界民”的战斗展开。